Data

Owned by Matthew Kutugata
Last updated: Dec 19, 2022
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Various types of data are used and produced during processing. Full resolution images are the main data input and are processed to produce plant segments, or cutouts, various types of masks, and metadata products for both original images and cutouts. This section describes how this is data structured, details its contents, and documents Image and Cutout metadata at length.

Directory Structure

data ├── semifield-developed-images │   ├── NC_2022-07-27 │   │ ├── NC_2022-07-27.json │   │   │ │   │   ├── autosfm │   │   │   ├── NC_2022-07-27_preview.png │   │   │   ├── detections.csv │   │   │   ├── dem │   │   │   │   └── dem.tif │   │   │   ├── downscaled_photos │   │   │   │   ├── NC_1658926241.png │   │   │   │   ├── NC_1658926255.png │   │   │ │ └── ... │   │   │   ├── downscaled_masks │   │   │   │   ├── NC_1658926241_mask.png │   │   │   │   ├── NC_1658926255_mask.png │   │   │ │ └── ... │   │   │   ├── ortho │   │   │   │   └── orthomosaic.tif │   │   │   ├── project │   │   │   │   ├── NC_2022-07-27.psx │   │   │   │   └── NC_2022-07-27.files │   │   │   └── reference │   │   │      ├── camera_reference.csv │   │   │      ├── error_statistic.csv │   │   │      ├── fov.csv │   │   │ └──gcp_reference.csv │   │   │ │   │   ├── images │   │   │   ├── NC_1658926241.png │   │   │   ├── NC_1658926255.png │   │   │ └── ... │   │   │ │   │   ├── masks │   │   │   ├── NC_1658926241_mask.png │   │   │   ├── NC_1658926255_mask.png │   │ │ └── ... │   │   │ │   │   ├── plant-detections │   │   │   ├── NC_1658926241.csv │   │   │   ├── NC_1658926255.csv │   │   │ └── ... │   │   │ │   │   ├── metadata │   │   │   ├── NC_1658926241.json │   │   │   ├── NC_1658926255.json │   │   │ └── ... │   │ │ │ │ └── metamasks │ │ ├── semantic_masks │   │      │   ├── NC_1658926241.png │   │      │   ├── NC_1658926255.png │   │   │ └── ... │   │      └── instance_masks │   │         ├── NC_1658926241.png │   │         ├── NC_1658926255.png │   │   └── ... │ └── ... │ ├── semifield-cutouts │   ├── NC_2022-07-27 │   │   ├── NC_1658926241_0.png │   │   ├── NC_1658926241_0.json │   │   ├── NC_1658926241_0.jpg │   │   ├── NC_1658926241_0_mask.png │   │   └── ... │   └── ... │ └── semifield-utils ├── MD │   ├── shapefiles │ │ │   ├── MD.shp │ │ │ └── ... │ │ └── GroundControlPoints.csv ├── NC │   ├── shapefiles │ │   ├── NC.shp │ │ └── ... │ └── GroundControlPoints.csv └── species_info.json