Directory Structure
Processing occurs within the main SemiF-AnnotationPipeline repository which used for temporary data storage. Resulting data for each batch is then moved to the respective permanent blob locations.
SemiF-AnnotationPipeline
└── data
├── semifield-developed-images
│ ├── NC_2022-07-27
│ │ ├── NC_2022-07-27.json
│ │ │
│ │ ├── autosfm
│ │ │ ├── detections.csv
│ │ │ ├── dem
│ │ │ │ └── dem.tif
│ │ │ ├── downscaled_photos
│ │ │ │ ├── NC_1658926241.png
│ │ │ │ ├── NC_1658926255.png
│ │ │ │ └── ...
│ │ │ ├── downscaled_masks
│ │ │ │ ├── NC_1658926241_mask.png
│ │ │ │ ├── NC_1658926255_mask.png
│ │ │ │ └── ...
│ │ │ ├── ortho
│ │ │ │ └── orthomosaic.tif
│ │ │ ├── project
│ │ │ │ ├── NC_2022-07-27.psx
│ │ │ │ └── NC_2022-07-27.files
│ │ │ └── reference
│ │ │ ├── camera_reference.csv
│ │ │ ├── error_statistic.csv
│ │ │ ├── fov.csv
│ │ │ └──gcp_reference.csv
│ │ │
│ │ ├── images
│ │ │ ├── NC_1658926241.png
│ │ │ ├── NC_1658926255.png
│ │ │ └── ...
│ │ │
│ │ ├── masks
│ │ │ ├── NC_1658926241_mask.png
│ │ │ ├── NC_1658926255_mask.png
│ │ │ └── ...
│ │ │
│ │ └── metadata
│ │ ├── NC_1658926241.json
│ │ ├── NC_1658926255.json
│ │ └── ...
│ │
│ └── ...
│
├── semifield-cutouts
│ ├── NC_2022-07-27
│ │ ├── NC_1658926241_0.png
│ │ ├── NC_1658926241_0.json
│ │ ├── NC_1658926241_1.png
│ │ ├── NC_1658926241_1.json
│ │ ├── NC_1658926255_0.png
│ │ ├── NC_1658926255_0.json
│ │ └── ...
│ └── ...
│
├── semifield-models
│ └── plant_detector
│ └── best.pt
│
├── semifield-upload-images
│ └── ...
│
└── semifield-utils
├── MD
│ ├── shapefiles
│ │ │ ├── MD.shp
│ │ │ └── ...
│ │ └── GroundControlPoints.csv
├── NC
│ ├── shapefiles
│ │ ├── NC.shp
│ │ └── ...
│ └── GroundControlPoints.csv
└── species_info.json
Batches
blob_home and data_root - storage location information
batch_id - unique batch identifier
upload_datetime - when image were uploaded to “uploads” blob storage
image_list - list of images contained in a single batch folder
schema_version - version of data schema used for organizing metadata
{
"blob_home": "data",
"data_root": "semifield-developed-images",
"batch_id": "NC_2022-08-05",
"upload_datetime": "2022-08-19_21:28:37",
"image_list": [
"images/NC_1659710908.jpg",
"images/NC_1659711200.jpg",
"images/NC_1659706234.jpg",
...
"images/NC_1659709264.jpg",
"images/NC_1659715086.jpg",
"images/NC_1659706245.jpg"
],
"schema_version": "1.0"
}
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